
Sebagaimana layaknya sebuah yayasan sesuai undang-undang, YPIA memiliki struktur organisasi berikut:
Pembina YPIA

- Dr. Setyanto P. Santosa, MA, QIA - Ketua
- Azhari, SE., MM, QIA - Sekretaris
- Prof. Dr. Mardiasmo, MBA, Akt, QIA
- Drs. H.M. Chatim Baidaie, Ak, QIA, CFE
- Drs. H. Achmad Subianto, MBA, QIA
- Drs. Ridwan Fatarudin, Ak, QIA, CRMP, CA
- Prof. Dr. Hiro Tugiman, Ak, QIA, CRMP, CA
- Drs. Syaiful Amir, SE., Ak
- Ir. Ogi Prastomiyono, MBA, QIA, CCSA, CISA
- DR. Maliki Heru Santosa, Ak., MBA, CA, CRMP, FCMA, CGMA, QIA.
.
.
Pengawas YPIA

- Drs. Hadi Rachmansyah Pane, Ak, QIA - Ketua
- Drs. K. Ridwan Nur, SE., MM., QIA, CFrA, CBA, CFE
- Drs. Husein Sani, QIA
.
.
Pengurus YPIA

- Ir. Martiono Hadianto, MBA, QIA - Ketua
- H. Darwis A. Rahman, SE, QIA - Wakil Ketua 1
- Riduan Simanjuntak, Ak., MBA, CIA, CISA, AAAIK, CRGP, QIA - Wakil Ketua 2
- Budi Sumartoyo, SE, Ak, MBA, CA, CISA, CIA, CFSA, QIA - Sekretaris
- Dra. Arnida M. Chaidir, Msi, QIA - Bendahara